Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg7Q5RJH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms