Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlha9Q5RJB0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms