Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav8d-2Q5R1B6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav8d-2Q5R1B6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms