Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc38a8Q5HZH7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms