Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm2Q5FW85 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm2Q5FW85 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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