Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Trpm3Q5F4S9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms