Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkaa1Q5EG47 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms