Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nlrc3Q5DU56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nlrc3Q5DU56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc3Q5DU56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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