Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms