Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chsy3Q5DTK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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