Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms