Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eme2Q56A04 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms