Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpjQ569L8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CenpjQ569L8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms