Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prune2Q52KR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prune2Q52KR3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms