Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms