Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnl1Q52KE7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms