Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc47Q505F5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms