Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms