Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Herc2Q4U2R1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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