Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3lQ4KL14 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms