Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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