Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Carmil2Q3V3V9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms