Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnah12Q3V0Q1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms