Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm906Q3V0M1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm906Q3V0M1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms