Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc43Q3V0L5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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