Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rimbp3Q3V0F0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rimbp3Q3V0F0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms