Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5aQ3UXZ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5aQ3UXZ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms