Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms