Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lgr6Q3UVD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr6Q3UVD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms