Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms