Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms