Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms