Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa3Q3UPR0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisa3Q3UPR0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisa3Q3UPR0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms