Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep63Q3UPP8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep63Q3UPP8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms