Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec31aQ3UPL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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