Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms