Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skap2Q3UND0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms