Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms