Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrch2Q3UMG5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms