Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms