Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mccc2Q3ULD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc2Q3ULD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms