Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ell2Q3UKU1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms