Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pid1Q3UBG2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pid1Q3UBG2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms