Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms