Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf166Q3U9F6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf166Q3U9F6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf166Q3U9F6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf166Q3U9F6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms