Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gtpbp6Q3U6U5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gtpbp6Q3U6U5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gtpbp6Q3U6U5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gtpbp6Q3U6U5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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