Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ulk3Q3U3Q1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ulk3Q3U3Q1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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