Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf6Q3TWW8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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