Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc136Q3TVA9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms