Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CiartQ3TQ03 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CiartQ3TQ03 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms